海藻酸钠的分子结构与淀粉和纤维素颇为相似,所不同的是在第5位碳原子上以羧基(—COOH)取代了羟甲基(—CH2OH),而在2,3位碳原子上也同样具有仲醇基。正是由于其羧基的存在,加碱生成羧酸钠盐而具有水溶性和阴荷性,因此,虽然海藻酸钠分子中也含有仲醇基,但因其阴荷性羧基与阴荷性的活性染料相互排斥,使活性染料无法接近仲醇基与之键合,所以,海藻酸钠不会与活性染料反应,它是调制活性染料色浆的理想原糊。
在活性染料印花中,其给色量高,印制精细花纹轮廓清晰,渗透性好,尤其是满地大花得色均匀,且由于其可溶于水,易于洗涤,印花手感柔软,印花时粘附于花筒及筛网的色浆易去除。